આ સંસ્થાના પુસ્તકાલયની સ્થાપના મુનિશ્રી પુણ્યવિજયજી મહારાજ દ્વારા કરવામાં આવી હતી, જેમણે 10,000 દુર્લભ પુસ્તકો અને 2000 પોથીઓ (હસ્તપ્રતોનો સંગ્રહ) ભેટમાં આપ્યાં હતાં. આ સમૃદ્ધ પ્રારંભિક સંગ્રહ ઇતિહાસ, ધર્મ, તત્ત્વજ્ઞાન, સંસ્કૃતિ, વિજ્ઞાન, ટેક્નોલોજી, જ્યોતિષ, ખગોળશાસ્ત્ર, આયુર્વેદ, કલા, સ્થાપત્ય, ભાષા અને સાહિત્ય વગેરે વિષયો સાથે સંબંધિત છે. પુસ્તકાલયમાં વિવિધ ભંડારો (પાટણ, લીમ્બડી પૂના, વડોદરા, કેમ્બે, કોબા, મદ્રાસ, જયપુર વગેરે) ના સૂચિગ્રંથોનો અનન્ય સંગ્રહ પણ છે. 

વર્તમાન પુસ્તકાલયમાં 60,000 પુસ્તકો અને સંશોધન સામયિકોના 8000 બાઉન્ડ ગ્રંથો  છે. સંગ્રહમાં જૈન સાહિત્ય, બૌદ્ધ ધર્મ, હિંદુ ધર્મ (વેદ, પુરાણ, સંહિતા, રામાયણ, ભગવદ્ ગીતા, મહાભારત), કલા અને સ્થાપત્ય અને તત્ત્વજ્ઞાનના વિષયોનો સમાવેશ થાય છે.

આ પુસ્તકાલયનો સંગ્રહ વિવિધ ભાષાઓમાં છે: મુખ્યત્વે ગુજરાતી, હિન્દી, સંસ્કૃત, પાલી, પ્રાકૃત, તમિલ, બંગાળી અને મરાઠી ભાષાઓ. આ સંગ્રહમાં ફ્રેન્ચ, જર્મન, જાપાનીઝ, ફારસી અને અંગ્રેજી ભાષાનાં કેટલાંક પુસ્તકોનો પણ સમાવેશ થાય છે.

પુસ્તકાલય પ્રાચ્યવિદ્યાના વિષયોને લગતા વિશેષ વિષયોના સંશોધન પર ભાર મૂકે છે. આ ક્ષેત્રની ક્ષમતામાં, પ્રસ્તુત સંગ્રહ સમગ્ર ભારતમાંથી તેમજ આંતરરાષ્ટ્રીય સ્તરેથી વિદ્વાનો અને વિદ્યાર્થીઓને આકર્ષિત કરે છે.